อย่างไรก็ตาม การลงทะเบียนผ่านเว็บไซต์ www.บ้านเพื่อคนไทย.th ซึ่งมี 5 ขั้นตอนหลัก ได้แก่  กรอกข้อมูลส่วนบุคคล, ข้อมูลคุณสมบัติเข้าร่วมโครงการ, ข้อมูลด้านที่อยู่อาศัย, ข้อมูลคำนวณวงเงินกู้เบื้องต้น และ ขั้นตอนสุดท้ายเป็นหน้าสรุปข้อมูล แต่กลับพบปัญหาใช้งานไม่ได้โดยขึ้นข้อความว่า “ขณะนี้มีผู้เข้าใช้งานเป็นจำนวนมาก โปรดรอสักครู่” สร้างความผิดหวังให้กับผู้ที่ต้องการเข้าไปจองสิทธิ์แต่ไม่สามารถทำได้สำเร็จจนถึงขณะนี้ (15.30 น.)